我认为图5中显示的EAS PRS表现尚不足以证明该声明,这似乎暗示目前最佳的EAS PRS模型达到了或超过了最佳的EUR模型。由于这些PRSmix+ EAS PRS仅在363k + 80k的台湾TPMI样本上进行了训练和调优,因此使用可比方法训练的EUR PRS在同样良好表型的EUR测试集上仍然表现出(更)好的性能。 例如,这个新的PRSmix+,TPMI训练的EAS T2D PRS在TPMI中实现了责任规模R^2 = 8.5%(表S14),使用来自89k EAS T2D病例和325k EAS T2D对照的数据(表S1),而Herasight的EUR T2D PRS使用Suzuki等人发布的GWAS关联进行训练,来源于254k EUR T2D病例和1.49m EUR T2D对照,在UK Biobank中实现了责任规模R^2 = 20.7%(16.8, 24.8)[2]。(其他团队也训练了类似的高预测性EUR T2D PRS [3],超过了这里设定的R^2 = 8.5%的阈值)。 但这并不是说通过将这个新的EAS GWAS与其他可用的EAS GWAS结合起来,无法训练出大幅改进的EAS PRS!例如,来自Suzuki等人多种族T2D GWAS的有效样本量的20%是由非TPMI EAS来源贡献的。 关于这一点的新结果即将发布!